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领核销单前应至少提前一天在网上申请。登陆中国电子口岸：出口收汇——核销单申请——填写申请份数——申请
到达外汇管理局后，先排队取号，按柜台取号（20号柜台）
领核销单需带：核销单领取证、中国电子口岸IC卡、领取人身份证（需与领取证和IC卡上操作人姓名一致）

最好带一只笔，因为领取后需要在领取清单上签名，而柜台有时不提供笔。核销单领取之后应及时网上备案。

登陆中国电子口岸：出口收汇——口案备案——输入核销单号码（通常选择“以……开头”选项，输入刚领取的核销单号码前几位，即可查询到所领取的全部核销单，按顺序一份份点进去，在海关那一栏输入2200并回车，显示“上海海关”，点击左上角“备案”。备案好一份后，点击“返回”，回到刚才所显示的全部核销单，再点击另一核销单号码，依次完成备案。全部完成后可在“状态查询”一栏查询到刚才备案的全部核销单状况，由于数据传送的时间差问题，需要等待一段时间才能看到全部核销单的状态一致。）

最后别忘记在核销单上盖公司公章和单位代码章。
核销前的准备

银行水单
日本方汇款到公司外币账户后，银行方面会打电话过来通知（也可主动打电话过去询问），并要求提供：货物名称（如果有很多货品，只需要提供一个就可以，通常都提供核销单上所写的货物名称）、核销单号码、发票号码或报关单号码，出口金额。提供这些信息给银行方面后，记得询问何时可去取“涉外收入申报单（对公）出口收汇核销专用联”，也就是俗称的水单，（真正的水单是一小张绿色单据，供财务做帐用），去外汇管理局核销时必须有。
如果收到的是预收款，无法提供核销单号码，可在知道核销单号码后自行在水单上填写，再找银行盖章。如果水单还在银行那里，只要打电话告诉他们就行。
（为什么不是汇款后马上可以取水单？银行在得到我们提供的核销单号码等信息后，会把这些信息传给外汇管理局，外汇管理局再将信息回传给银行，银行取得信息后再打印水单。基本上从收款到可申报需要七八天的时间，具体可参见水单上的提示申报日期。）

出口后大约一个月，报关单和核销单退回来了。这时应先到网上交单。
报关单
报关单的交单，登陆中国电子口岸：出口退税——数据报送

核销单
核销单的交单，同样进入中国电子口岸：出口收汇——企业交单以上三项准备工作应在准备去核销之前至少一个礼拜做好，因为数据的传送需要时间。

核销
核销需要带：水单、核销单、报关单。将这三单按此顺序排列，核销单拉开横放（也就是三单上的字排列方向一致）。如果一张水单对应两张及两张以上核销单（一笔汇款的货物分了两次或两次以上出货，就会有不止一张核销单，而因为汇款是一次性付过来的，所以只有一张水单），则将核销单按顺序全部放在水单后面，之后再按顺序摆放报关单；如果两张及两张以上水单对应一张核销单，则将水单按顺序全部放在核销单前。

到外汇管理局后排队取号：按柜台取号（5、7、8号柜台），按业务取号（出口收汇——出口数据预录入）。这时取得两张同样数字的号码单，一张自己拿着，省得待会忘记了自己的号码；另一张用回形针与水单、核销单、报关单别在一起在叫到号后将其放到柜台上排队，然后就在柜台边上等待，做数据录入的人来取三单时会叫号，请关注是哪位录入员拿了你的单子，在她录入完毕后，也请留意她把单子送到哪台打印机由哪位工作人员处理，等核销清单打印出来后这位工作人员会拿着一叠清单到柜台叫公司名字发放清单（声音一般都很轻，大厅里人又很多很嘈杂，所以才要时刻关注你的单据处理流程，以便迅速做出反应）。
在拿到核销清单后，需要交钱盖章（一张核销单20元），交钱盖章处有时就在你领取清单的地方，有时需要换地方。看哪里有人拿着清单和钱在排队就去跟着排队。交钱盖章后会给你一张发票。
以上程序完成后，到9号柜台旁边领取已经盖了核销章的水单、核销单和报关单。需要你说出你的号码，并把号码单交还给工作人员（一般都是出示后扔进柜台上的盒子里）。到这里核销完毕。
注：关于样品核销——样品不收汇没有水单，只要带核销单和报关单去就可以。其他程序都相同，只是最后在交钱盖章拿发票后，不需要再去排队领核销单和报关单，因为样品核销的话这两单是被收回的。

单笔核销收汇与出口金额差的浮动范围为上下5000美元。单票可以差额5000美元,批次核销按票数来平均.但网上核销的话,差额部分只能在报关金额的5%以内,才可以自动通过,通不过要到外管局前台去人工审核,视具体情况看能不能通过。

注：关于差额核销 ——需要写差额原因说明函，说明造成收汇金额与出口金额之间数额差的原因，由法人签字，盖公章。
差额核销在外汇管理局9号柜台办理申请。

差额核销
提示：指各种因素造成的收汇差额。按造成差额原因的情况提交材料。
1、差额原因说明（盖公司印鉴）；
2、出口合同；
3、盖有海关验讫章的出口收汇核销单；
4、盖有海关验讫章的出口货物报关单；
5、出口收汇核销专用联（水单）；
6、相关商会证明或有关交易所行情报价资料；
7、进口国商检证明或进口商有关函件；
8、报刊新闻媒体的报道资料或我国驻进口国使领馆商务处出具的证明。